FONAVIPO cuenta con una estructura organizacional acorde a la gestión integral de riesgos, con la debida segregación de funciones y niveles jerárquicos, así como, los niveles de dependencia, de conformidad con la naturaleza de las operaciones, conformada de la siguiente manera: Junta Directiva, Comité de Prevención de Lavado de Dinero y Activos, Comité de Riesgos, Dirección Ejecutiva, Unidad de Riesgo, las evaluaciones separadas y las áreas de apoyo y operativas.
